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阿里云智能達(dá)摩院-新冠肺炎全基因組測(cè)序智能分析

來(lái)源:人工智能產(chǎn)業(yè)發(fā)展聯(lián)盟      編輯:創(chuàng)澤      時(shí)間:2020/6/11      主題:其他   [加盟]

抗疫期間所解決的業(yè)務(wù)需求

快速準(zhǔn)確的診斷新冠肺炎,并研究病毒基因組的演化,以便確定病毒的來(lái)源及傳播。

解決方案及特色

基因組檢測(cè)需要做到快速準(zhǔn)確,對(duì)海量測(cè)序數(shù)據(jù)做到快速分析需要強(qiáng)大的計(jì)算和存儲(chǔ)系統(tǒng)。依托阿里云強(qiáng)大的云平臺(tái),支持線上和本地化大數(shù)據(jù)套件部署。
基因組數(shù)據(jù)分析方面,主要提供并行、分布式的大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。功能包括序列質(zhì)控、序列比對(duì)、序列拼接。每個(gè)步驟經(jīng)過(guò)優(yōu)化設(shè)計(jì)和參數(shù)調(diào)優(yōu)使得對(duì)于 CPU 和內(nèi)存的利用更為高效,從而有效減少了數(shù)據(jù)分析的時(shí)間。此外,系統(tǒng)提供友好界面,并支持一鍵出分析報(bào)告功能。
除了病原體檢測(cè)之外,對(duì)于不同來(lái)源病原體的序列和結(jié)構(gòu)分析有助于實(shí)現(xiàn)病原體的朔源和對(duì)應(yīng)藥物分析。進(jìn)化分析以及基于深度學(xué)習(xí)的人工智能算法能夠加速并且精準(zhǔn)實(shí)現(xiàn)預(yù)期目的。
系統(tǒng)采用云架構(gòu),支持線上和用戶本地部署。配合阿里云專有云的 Iaas 和 Paas 系統(tǒng),快速搭建大數(shù)據(jù)平臺(tái)。該平臺(tái)采用分布式存儲(chǔ)和分布式計(jì)算系統(tǒng),有效解決基因測(cè)序數(shù)據(jù)量大,分析計(jì)算需要分布式或并行方式的特點(diǎn);谠摯髷(shù)據(jù)平臺(tái),分析速度能有效提升 4~10 倍,人工智能分析處理速度也大幅提升。

應(yīng)用與效果

全基因組測(cè)序技術(shù)在全國(guó)進(jìn)行應(yīng)用實(shí)踐。阿里達(dá)摩院在浙江省疾控中心和武漢金銀潭醫(yī)院做試點(diǎn)應(yīng)用,效果不錯(cuò),整體準(zhǔn)確率非常高。

產(chǎn)學(xué)研結(jié)合情況及效果

在我們的實(shí)際應(yīng)用中,該項(xiàng)技術(shù)整合了生物制藥企業(yè)、人工智能企業(yè)、醫(yī)療機(jī)構(gòu)、高校等各方技術(shù)力量,從試劑研發(fā)、數(shù)據(jù)分析、流程設(shè)計(jì)等多角度全方位的設(shè)計(jì)來(lái)改進(jìn)和完善技術(shù)。





平安-HRV 指尖檢測(cè)及正念訓(xùn)練引導(dǎo)

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聯(lián)著實(shí)業(yè)-智能化社區(qū)新冠肺炎疫情防控應(yīng)急科普系統(tǒng)

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平臺(tái)在寧波等地上線,可對(duì)寧波醫(yī)療機(jī)構(gòu)進(jìn)行多維度動(dòng)態(tài)監(jiān)管,還原疫情發(fā)生的全過(guò)程,助力疫情防控流程的改進(jìn)、疫情的研判和預(yù)測(cè)

云從-大鴻疫情防控智能終端和疫情防控系統(tǒng)

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北京新場(chǎng)景方案聚焦十個(gè)重點(diǎn)任務(wù),構(gòu)建“1+5”系列政策體系,實(shí)施應(yīng)用場(chǎng)景“十百千”工程

6月10日,北京市發(fā)布《關(guān)于加快培育壯大新業(yè)態(tài)新模式促進(jìn)北京經(jīng)濟(jì)高質(zhì)量發(fā)展的若干意見》和“新基建、新場(chǎng)景、新消費(fèi)、新開放、新服務(wù)”5個(gè)行動(dòng)方案,構(gòu)建“1+5”系列政策體系

重構(gòu)ncnn,騰訊優(yōu)圖開源新一代移動(dòng)端推理框架TNN

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符合《工業(yè)機(jī)器人行業(yè)規(guī)范條件》的企業(yè)名單(第三批)

企業(yè)名單:寧夏巨能機(jī)器人,青島科捷機(jī)器人,中國(guó)電器科學(xué)研究院,西安航天精密機(jī)電研究所,機(jī)械工業(yè)第九設(shè)計(jì)研究院, 一汽模具,廈門航天思爾特機(jī)器人, 長(zhǎng)沙長(zhǎng)泰機(jī)器人,安徽瑞祥工業(yè)

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達(dá)摩院金榕教授介紹了語(yǔ)音、自然語(yǔ)言處理、計(jì)算機(jī)視覺三大核心AI技術(shù)的關(guān)鍵進(jìn)展,并就AI技術(shù)在在實(shí)際應(yīng)用中的關(guān)鍵挑戰(zhàn),以及達(dá)摩院應(yīng)對(duì)挑戰(zhàn)的創(chuàng)新實(shí)踐進(jìn)行了解讀

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